بررسی تنوع ژنتیکی جدایه‌های کلبسیلا پنومونیه دامی و انسانی با استفاده از روش ERIC-PCR و تعیین الگو حساسیت آنتی‌بیوتیکی

کلبسیلا پنومونیه، از جمله پاتوژ‌نهای فرصت طلب و عامل عفونت در انسان و حیوانات می‌باشد. مقاومت به آنتی بیوتیک در جدایه‌های کلبسیلا پنومونیه در حال افزایش است. تست حساسیت ضد میکروبی قبل از تجویز آنتی‌بیوتیک‌ها، لازم به نظر می‌رسد. هدف از مطالعه حاضر تعیین تایپ جدایه‌های بالینی و دامی کلبسیلا پنومونیه و ارزیابی حساسیت آنتی‌بیوتیکی بود. در مجموع 100 جدایه بالینی و دامی کلبسیلا پنومونیه از شهرستان بابک جمع‌آوری شد. حساسیت آنتی بیوتیکی با روش کربی بائر با توجه به دستورالعمل CLSI انجام شد. سپس، استخراج DNA ژنومی با استفاده از کیت DNA انجام و واکنش زنجیره‌ای پلیمراز با پرایمر ERIC1 و ERIC2 انجام گردید. نتایج نشان داد که تمامی سویه‌های تحت مطالعه (100%) به آنتی‌بیوتیک‌های آمپی سیلین و آمیکاسین مقاوم بودند. بیشترین و کمترین میزان مقاومت مریوط به تتراسیکلن (53 سویه؛ 3/88%) و ایمی پنم (8 جدایه؛ 3/13%) بود. نتایج حاصل از تجزیه خوشه‌ای و ترسیم دندروگرام بر اساس شباهت‌های ژنتیکی، نمونه‌های مورد مطالعه را به هفده گروه مجزا تفکیک نموده است. با توجه به یافته های این مطالعه، مقاومت به آنتی بیوتیک در بین جدایه‌های کلبسیلا پنومونیه در حال افزایش می‌باشد. علاوه بر این، توال‌های ERIC دارای جفت بازی هستند که حاوی تکرارهای معکوس و مرکزی به شدت حفاظت شده بوده و در نواحی خارج ژنی ژنوم باکتری‌ها قرار گرفته اند و در تعیین تنوع ژنتیکی میان تمامی جدایه پیچیدگی کمتری دارند اما تفکیک خوبی در سطح سویه ایجاد می‌کنند.